112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5007 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  100 
 
 
850 aa  1693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  37.54 
 
 
693 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  37.48 
 
 
541 aa  283  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  39.76 
 
 
727 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  40.99 
 
 
535 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  43.04 
 
 
558 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  37.35 
 
 
408 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  40.45 
 
 
403 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40 
 
 
547 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  39.05 
 
 
471 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  38.7 
 
 
407 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  38.85 
 
 
408 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  39.28 
 
 
604 aa  237  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.11 
 
 
567 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  33.74 
 
 
411 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  34.85 
 
 
399 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.35 
 
 
548 aa  218  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  37.78 
 
 
597 aa  217  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.39 
 
 
568 aa  216  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  36.52 
 
 
387 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  36.09 
 
 
574 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.89 
 
 
631 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  34.12 
 
 
413 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  30.37 
 
 
636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  29.77 
 
 
535 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.9 
 
 
640 aa  159  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.31 
 
 
434 aa  154  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.43 
 
 
535 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 
677 aa  146  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  29.31 
 
 
658 aa  141  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  26.92 
 
 
532 aa  138  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 
612 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  28.51 
 
 
583 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  26.83 
 
 
533 aa  134  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  31.23 
 
 
320 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.95 
 
 
441 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.95 
 
 
737 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  24.66 
 
 
433 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.61 
 
 
445 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.01 
 
 
589 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.37 
 
 
1392 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  41.84 
 
 
1471 aa  98.6  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  38.71 
 
 
970 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
693 aa  94  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  40.14 
 
 
2095 aa  94  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  36.43 
 
 
591 aa  94  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  38.73 
 
 
2095 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 
601 aa  89  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.05 
 
 
1424 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  25.5 
 
 
469 aa  87.4  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  36.57 
 
 
1173 aa  87  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  26.9 
 
 
587 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  40.52 
 
 
1264 aa  86.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  41.41 
 
 
1001 aa  82  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  24.94 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  36.17 
 
 
812 aa  80.5  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  23.09 
 
 
453 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.67 
 
 
805 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  41.74 
 
 
1193 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  33.33 
 
 
597 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  24.59 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  27.7 
 
 
1193 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.48 
 
 
1172 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  21.66 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.08 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  30 
 
 
1108 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.32 
 
 
1206 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  24.7 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  38.32 
 
 
1069 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  22.91 
 
 
445 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.03 
 
 
1236 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.23 
 
 
687 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.6 
 
 
1289 aa  60.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.1 
 
 
1295 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  30.89 
 
 
1965 aa  57.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.4 
 
 
704 aa  57.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.67 
 
 
1343 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  29.61 
 
 
2142 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.56 
 
 
688 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  22.94 
 
 
440 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  34.52 
 
 
690 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.94 
 
 
1212 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.81 
 
 
709 aa  54.3  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.58 
 
 
1329 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.27 
 
 
424 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.2 
 
 
698 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  31.25 
 
 
1479 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  35.29 
 
 
1548 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.16 
 
 
1781 aa  52  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  37.97 
 
 
1119 aa  51.6  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  34.68 
 
 
927 aa  51.2  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 
1357 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  26.34 
 
 
1465 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  26.47 
 
 
1311 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  34.59 
 
 
1135 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  26.58 
 
 
1687 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.67 
 
 
639 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.61 
 
 
469 aa  48.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.56 
 
 
953 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  26.89 
 
 
704 aa  47.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>