72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4945 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  71.43 
 
 
153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  70.34 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  52.34 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  48.53 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  49.32 
 
 
156 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  51.97 
 
 
143 aa  120  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  47.86 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  44.62 
 
 
145 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  42.28 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  42.52 
 
 
141 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  39.85 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  45.97 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  41.94 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  37.98 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  41.22 
 
 
180 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  41.22 
 
 
180 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  41.22 
 
 
180 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  39.68 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  38.35 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  39.2 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  38.4 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  41.18 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  38.98 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  44.17 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  40.31 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  42.98 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  37.7 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  36.84 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  38.3 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  35.34 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  33.83 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  34.11 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  35.34 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  37.21 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  36.59 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  35.2 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  35.66 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.17 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  38.1 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  38.66 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  37.93 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  38.21 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  35.82 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  35.9 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.1 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  29.6 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.43 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.71 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.6 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.45 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.84 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.25 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  30.95 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  31.45 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.4 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  33.06 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  28.15 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  37.31 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  32.99 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.62 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  30.33 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  31.78 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  34.34 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  31.62 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  31.62 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  31.62 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  28.15 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>