198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4912 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  100 
 
 
547 aa  1109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  65.4 
 
 
535 aa  678  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  52.03 
 
 
567 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  45.51 
 
 
548 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  44.06 
 
 
558 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  50.27 
 
 
693 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  46.32 
 
 
541 aa  362  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  40.34 
 
 
597 aa  357  2e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  47.93 
 
 
403 aa  357  3e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  45.63 
 
 
408 aa  352  8e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.5241e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  45.96 
 
 
407 aa  337  3e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.4 
 
 
574 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  37.94 
 
 
568 aa  332  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  44.69 
 
 
408 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  44.99 
 
 
471 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  41.14 
 
 
604 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  45.9 
 
 
727 aa  315  1e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  40.26 
 
 
411 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  40.84 
 
 
399 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  6.54104e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  41.3 
 
 
387 aa  275  1e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  34.67 
 
 
589 aa  263  9e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  40 
 
 
850 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  84.38 
 
 
500 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  37.57 
 
 
413 aa  222  1e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  34.91 
 
 
469 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  33.04 
 
 
636 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  69.93 
 
 
801 aa  202  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  70.71 
 
 
490 aa  201  4e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  34.27 
 
 
583 aa  197  5e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  72.44 
 
 
472 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.55 
 
 
631 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.98 
 
 
493 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  31.54 
 
 
640 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  76.19 
 
 
468 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  31.76 
 
 
535 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86405e-06 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  32.73 
 
 
535 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  69.92 
 
 
461 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  70.87 
 
 
498 aa  186  1e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.53 
 
 
434 aa  184  4e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  37.28 
 
 
320 aa  184  5e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  30.79 
 
 
532 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  68.25 
 
 
451 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.99 
 
 
658 aa  175  1e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  69.05 
 
 
489 aa  174  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.62 
 
 
533 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.82 
 
 
737 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.74 
 
 
677 aa  168  3e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  65.08 
 
 
380 aa  165  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  66.67 
 
 
374 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  62.2 
 
 
492 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  54.23 
 
 
469 aa  148  2e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  2.26989e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.45 
 
 
441 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  43.58 
 
 
603 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  56.8 
 
 
489 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.86 
 
 
612 aa  136  1e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  55 
 
 
801 aa  134  4e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  36.64 
 
 
368 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.52 
 
 
445 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  44 
 
 
497 aa  110  8e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.06 
 
 
450 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  24.65 
 
 
427 aa  107  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  25.64 
 
 
446 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.51 
 
 
587 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  22.65 
 
 
453 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  34.41 
 
 
801 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  25.68 
 
 
445 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  39.75 
 
 
803 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.62 
 
 
642 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  24.18 
 
 
440 aa  97.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.43 
 
 
424 aa  97.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  39.55 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  41.04 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.32 
 
 
634 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  42.97 
 
 
494 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  24.89 
 
 
442 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 
391 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.37243e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.19 
 
 
890 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.98 
 
 
933 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.46 
 
 
627 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 
709 aa  87.4  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  39.84 
 
 
446 aa  84.3  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  41.86 
 
 
373 aa  84  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.81 
 
 
531 aa  82.4  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.01 
 
 
516 aa  82.4  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  22.88 
 
 
469 aa  82  3e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  41.67 
 
 
384 aa  81.3  4e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.62 
 
 
435 aa  80.9  5e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  2.26064e-06  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.13 
 
 
414 aa  80.5  7e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  37.88 
 
 
165 aa  79.7  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.83 
 
 
1072 aa  78.2  4e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  33.62 
 
 
824 aa  78.2  4e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  37.29 
 
 
275 aa  77.8  5e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30 
 
 
476 aa  77.4  6e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.57688e-05  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  38.84 
 
 
732 aa  77.4  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  37.5 
 
 
452 aa  77  8e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  33.76 
 
 
417 aa  75.1  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.16 
 
 
1016 aa  74.7  4e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  31.62 
 
 
496 aa  73.9  7e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>