More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4883 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.68 
 
 		 1357 aa  1325    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.19 
 
 		 1343 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 1212 aa  2428    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  57.9 
 
 		 1548 aa  1294    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  33.72 
 
 		 905 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  31.26 
 
 		 717 aa  357  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 		 712 aa  341  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  31.8 
 
 		 733 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 		 747 aa  298  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  37.62 
 
 		 904 aa  287  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 805 aa  261  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 893 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  34.31 
 
 		 902 aa  254  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  29.7 
 
 		 803 aa  252  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.7 
 
 		 754 aa  252  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  28.65 
 
 		 750 aa  250  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  26.8 
 
 		 778 aa  250  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.86 
 
 		 756 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  26.67 
 
 		 778 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  31.29 
 
 		 875 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.48 
 
 		 762 aa  243  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 763 aa  243  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.77 
 
 		 889 aa  243  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.8 
 
 		 792 aa  243  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.66 
 
 		 790 aa  241  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.25 
 
 		 738 aa  241  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.06 
 
 		 734 aa  240  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  28.72 
 
 		 808 aa  240  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 751 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  29.78 
 
 		 763 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  26.1 
 
 		 772 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.51 
 
 		 881 aa  234  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  29.67 
 
 		 721 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  28.12 
 
 		 740 aa  231  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  28.05 
 
 		 745 aa  231  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 		 768 aa  231  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.09 
 
 		 784 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.25 
 
 		 780 aa  230  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  29.83 
 
 		 764 aa  229  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  29.81 
 
 		 764 aa  229  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 		 766 aa  227  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.3 
 
 		 749 aa  227  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  24.88 
 
 		 777 aa  227  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  27.46 
 
 		 1037 aa  227  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.37 
 
 		 742 aa  227  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.32 
 
 		 771 aa  227  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 772 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  27.3 
 
 		 859 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.17 
 
 		 758 aa  226  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.2 
 
 		 774 aa  225  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  28.55 
 
 		 760 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  29.32 
 
 		 759 aa  223  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.28 
 
 		 752 aa  223  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  26.32 
 
 		 762 aa  222  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  27.61 
 
 		 766 aa  223  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  25.9 
 
 		 740 aa  222  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  26.81 
 
 		 790 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.8 
 
 		 757 aa  221  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  34.42 
 
 		 882 aa  221  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.59 
 
 		 783 aa  221  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  27.93 
 
 		 737 aa  221  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  26.77 
 
 		 793 aa  221  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.92 
 
 		 757 aa  221  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.62 
 
 		 763 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  26.65 
 
 		 793 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  26.34 
 
 		 721 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  35.27 
 
 		 882 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.99 
 
 		 769 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  28.07 
 
 		 763 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 755 aa  218  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  28.42 
 
 		 735 aa  218  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  26.94 
 
 		 708 aa  218  7e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  29.47 
 
 		 763 aa  218  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.55 
 
 		 777 aa  218  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 764 aa  217  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.88 
 
 		 738 aa  218  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.91 
 
 		 799 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.91 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  25.65 
 
 		 717 aa  216  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.05 
 
 		 807 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  29.16 
 
 		 763 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.53 
 
 		 769 aa  214  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.34 
 
 		 727 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  30.13 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.16 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 753 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.38 
 
 		 727 aa  213  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.49 
 
 		 755 aa  213  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  30.13 
 
 		 755 aa  212  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.99 
 
 		 755 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  27.76 
 
 		 765 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.4 
 
 		 758 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  25.59 
 
 		 743 aa  211  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.31 
 
 		 760 aa  211  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.99 
 
 		 755 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.99 
 
 		 755 aa  211  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.56 
 
 		 755 aa  211  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  29.9 
 
 		 864 aa  210  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>