More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4817 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 541 aa  1087    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  56.82 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  56.27 
 
 		 562 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  55.51 
 
 		 539 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  51.63 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  51.8 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.4 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  46.65 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  46.86 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  43.33 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  43.41 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  43.26 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  43.73 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  43.07 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  43.73 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  43.07 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  42.75 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  43.24 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  42.28 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  41.51 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  43.4 
 
 		 530 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  44.04 
 
 		 527 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.03 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  42.3 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  38.81 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 532 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.73 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.32 
 
 		 543 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 		 509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.75 
 
 		 499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 501 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 516 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 500 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.1 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.26 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 553 aa  226  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 510 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 515 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 499 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 515 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  31.85 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 523 aa  222  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  29.17 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 520 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 497 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 497 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  31.08 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.82 
 
 		 544 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 662 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 538 aa  217  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.94 
 
 		 529 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 516 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.1 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  31.81 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  29.68 
 
 		 500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  29.68 
 
 		 500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.77 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.29 
 
 		 506 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 517 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  30.74 
 
 		 501 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 512 aa  213  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 521 aa  213  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  29.94 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 519 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  30.35 
 
 		 557 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  29.12 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  28.57 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.94 
 
 		 560 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 		 509 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.68 
 
 		 506 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>