53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4753 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  39.46 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  39.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.54 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  34.3 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  34.01 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.89 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  33.84 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  36.81 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.52 
 
 		 225 aa  88.2  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.09 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  33.86 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.39 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.15 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  32.16 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  32.28 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  28.03 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 102 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 95 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  24.37 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  24.37 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  24.37 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  23.53 
 
 		 149 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  23.53 
 
 		 149 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 259 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  32.2 
 
 		 109 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 149 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 124 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>