More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4732 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
483 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  57.53 
 
 
366 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  55.56 
 
 
385 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  52.74 
 
 
373 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  51.22 
 
 
368 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  53.42 
 
 
380 aa  256  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  49.04 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  52.88 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  54.68 
 
 
389 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  49.7 
 
 
386 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  54.76 
 
 
398 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  49.7 
 
 
386 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  49.7 
 
 
386 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  52.94 
 
 
369 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  57.14 
 
 
385 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  53.21 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  58.93 
 
 
368 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.65 
 
 
266 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  50.51 
 
 
385 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  53.19 
 
 
425 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  56.82 
 
 
373 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  49.63 
 
 
390 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  54.39 
 
 
372 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  59.62 
 
 
363 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  61.45 
 
 
370 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  42.16 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  58.6 
 
 
381 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  56.57 
 
 
357 aa  207  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  47.28 
 
 
372 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  45.27 
 
 
421 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  53.89 
 
 
433 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  52.35 
 
 
356 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  44.31 
 
 
389 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  42.64 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  50.81 
 
 
369 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  49.57 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.6 
 
 
244 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41 
 
 
248 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.31 
 
 
240 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  45.7 
 
 
338 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.78 
 
 
228 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  36.18 
 
 
316 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.94 
 
 
250 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  47.64 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  41.9 
 
 
225 aa  130  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.77 
 
 
242 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  46.58 
 
 
306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  35.15 
 
 
306 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.23 
 
 
233 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.31 
 
 
233 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  45.14 
 
 
323 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.63 
 
 
243 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.03 
 
 
233 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  43.51 
 
 
318 aa  123  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.83 
 
 
176 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.47 
 
 
228 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.86 
 
 
242 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  43.06 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.67 
 
 
230 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  43.75 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.19 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  41.25 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.24 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  39.87 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  38.5 
 
 
230 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  39.52 
 
 
341 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.68 
 
 
345 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.14 
 
 
340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  41.28 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  42 
 
 
342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  37.22 
 
 
315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40.88 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  35.11 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  37.22 
 
 
339 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  39.05 
 
 
341 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 
379 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  31.34 
 
 
400 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  39.05 
 
 
338 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.24 
 
 
353 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  40.67 
 
 
340 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  38.86 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  38.86 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.93 
 
 
249 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  43.04 
 
 
356 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  37.56 
 
 
343 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  37.14 
 
 
372 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  37.56 
 
 
343 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.5 
 
 
235 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.98 
 
 
242 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  32.18 
 
 
265 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.4 
 
 
233 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  47.06 
 
 
104 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  33.76 
 
 
342 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  47.06 
 
 
104 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  34.12 
 
 
346 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  35.87 
 
 
325 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  35.32 
 
 
343 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  38.64 
 
 
332 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>