More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4687 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  100 
 
 		 391 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  42.93 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  40.67 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  41.8 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  40.54 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  38.74 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  36.11 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  35.39 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  34.32 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.29 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  33.59 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.19 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.17 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.62 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.13 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  36.39 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.17 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  33.06 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  32.73 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.86 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.87 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.98 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.51 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.11 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  32.65 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  32.02 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.01 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.25 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.14 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.46 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.57 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  30.63 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  23.55 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  28.61 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  31.67 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  28.79 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.97 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.19 
 
 		 302 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.19 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  27.14 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.39 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.06 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  29.39 
 
 		 318 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  31.15 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.01 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  29.93 
 
 		 302 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.97 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.3 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.34 
 
 		 298 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.81 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.74 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.76 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.07 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.69 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.74 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.2 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  29.23 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.04 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.36 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.19 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.45 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.35 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.02 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  28.4 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.94 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  29.13 
 
 		 292 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  30.35 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  32.7 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  30.81 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  29.86 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  29.86 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  29.86 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.57 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  29.39 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.73 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  32.96 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.61 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.86 
 
 		 292 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.01 
 
 		 503 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.42 
 
 		 303 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  26.24 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.07 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.77 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  28.53 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  29.97 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  29.4 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  29.9 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.51 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.62 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.42 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.5 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.57 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.72 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  24.84 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  27.59 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.11 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  29.39 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.32 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
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