195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4685 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  48.8 
 
 
722 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
738 aa  1484    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  49.5 
 
 
722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  42.05 
 
 
679 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  50.57 
 
 
707 aa  485  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  42.18 
 
 
596 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  42.6 
 
 
589 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  47.48 
 
 
528 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  41.85 
 
 
566 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  45.61 
 
 
479 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  38.69 
 
 
605 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  41.67 
 
 
470 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  37.24 
 
 
612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  39.79 
 
 
494 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  37.33 
 
 
914 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  38.07 
 
 
688 aa  320  7.999999999999999e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  34.64 
 
 
563 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  38.39 
 
 
551 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.62 
 
 
1888 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  38.4 
 
 
661 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  34.91 
 
 
614 aa  277  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.08 
 
 
2156 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  25.44 
 
 
449 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  27.93 
 
 
470 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 
458 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 
453 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 
441 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  49.02 
 
 
661 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  24.48 
 
 
449 aa  94  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  47.92 
 
 
881 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  31.22 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  46.39 
 
 
881 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  46.39 
 
 
882 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  46.39 
 
 
882 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 
767 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 
461 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.17 
 
 
466 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.95 
 
 
623 aa  87.4  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  23.26 
 
 
458 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  48.91 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  51.14 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 
439 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  31.28 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  21.56 
 
 
703 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  47.95 
 
 
644 aa  74.3  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  41.11 
 
 
741 aa  74.7  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
521 aa  73.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.43 
 
 
559 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  23.5 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  26.81 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  38 
 
 
218 aa  70.1  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  39 
 
 
742 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  25 
 
 
532 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.11 
 
 
1975 aa  64.7  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  39.42 
 
 
619 aa  64.3  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  24.16 
 
 
549 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 
614 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  25.71 
 
 
472 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.19 
 
 
1942 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  22.19 
 
 
364 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2137  glycoside hydrolase starch-binding  33.33 
 
 
752 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1331  hypothetical protein  36.36 
 
 
753 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 
1017 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  23.18 
 
 
1021 aa  58.9  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  38.3 
 
 
555 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.56 
 
 
526 aa  58.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.47 
 
 
528 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.71 
 
 
484 aa  58.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  28.95 
 
 
528 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  36.84 
 
 
739 aa  58.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  28.95 
 
 
533 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.63 
 
 
464 aa  57.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
1010 aa  57.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.32 
 
 
606 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.32 
 
 
606 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  22.52 
 
 
513 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
539 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
1005 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.13 
 
 
1891 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.48 
 
 
462 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 
499 aa  54.7  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 
600 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 
570 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 
925 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 
524 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  25.27 
 
 
456 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  24.22 
 
 
566 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  22.47 
 
 
599 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  22.18 
 
 
513 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 
568 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  36.59 
 
 
249 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  23.9 
 
 
555 aa  52.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  22.64 
 
 
513 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  31.54 
 
 
725 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  31.54 
 
 
725 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.14 
 
 
620 aa  51.6  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  23.6 
 
 
604 aa  51.6  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.27 
 
 
513 aa  51.6  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.27 
 
 
513 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>