More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4651 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  100 
 
 
1548 aa  3071  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.48 
 
 
1212 aa  1300  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.2 
 
 
1343 aa  1142  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  61.42 
 
 
1357 aa  1397  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.13 
 
 
905 aa  370  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  29.35 
 
 
717 aa  323  2e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.75 
 
 
733 aa  314  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.49252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.95 
 
 
712 aa  306  2e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  29.53 
 
 
747 aa  292  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.26 
 
 
904 aa  274  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 
763 aa  265  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  29.23 
 
 
803 aa  259  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  28.43 
 
 
763 aa  254  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.95 
 
 
774 aa  249  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  27.7 
 
 
763 aa  248  7e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  25.47 
 
 
778 aa  248  7e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 
805 aa  247  1e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  32.39 
 
 
893 aa  247  1e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.52 
 
 
769 aa  246  2e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  33.89 
 
 
902 aa  246  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.93 
 
 
738 aa  245  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  25.26 
 
 
778 aa  245  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  27.46 
 
 
763 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.46 
 
 
763 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  28.87 
 
 
763 aa  244  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.26 
 
 
754 aa  239  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  26.24 
 
 
772 aa  238  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.26 
 
 
801 aa  237  1e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  27.67 
 
 
768 aa  236  2e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.04 
 
 
734 aa  234  8e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.05 
 
 
769 aa  234  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.33 
 
 
768 aa  233  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.28 
 
 
792 aa  232  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.24 
 
 
768 aa  232  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.47 
 
 
756 aa  231  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.64 
 
 
875 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  29.18 
 
 
721 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.94 
 
 
762 aa  228  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  27.53 
 
 
808 aa  226  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.46 
 
 
757 aa  226  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  27.02 
 
 
764 aa  226  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  34.82 
 
 
882 aa  225  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.71 
 
 
799 aa  225  5e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
881 aa  225  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  28.45 
 
 
765 aa  224  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  28.45 
 
 
755 aa  224  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  35.89 
 
 
882 aa  224  1e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
764 aa  224  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.01 
 
 
889 aa  224  1e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  28.32 
 
 
755 aa  223  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  28.32 
 
 
755 aa  223  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  28.32 
 
 
755 aa  223  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.48 
 
 
765 aa  221  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.48 
 
 
765 aa  221  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 
772 aa  221  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.48 
 
 
765 aa  221  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.27 
 
 
771 aa  221  8e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  26.58 
 
 
750 aa  221  9e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.48 
 
 
765 aa  221  9e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.48 
 
 
765 aa  221  9e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.48 
 
 
765 aa  221  9e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  27.38 
 
 
764 aa  220  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
753 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  28.29 
 
 
738 aa  221  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.36 
 
 
765 aa  219  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  27.07 
 
 
738 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.93 
 
 
742 aa  219  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  25.77 
 
 
745 aa  219  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  24.46 
 
 
777 aa  218  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.21 
 
 
807 aa  218  6e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.86 
 
 
795 aa  218  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.24 
 
 
765 aa  218  1e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.07 
 
 
784 aa  217  1e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.24 
 
 
765 aa  215  4e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  28.99 
 
 
765 aa  216  4e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  28.11 
 
 
765 aa  215  5e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  25.49 
 
 
1037 aa  215  5e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.3 
 
 
751 aa  214  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  25.82 
 
 
859 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  24.91 
 
 
762 aa  213  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  27.2 
 
 
743 aa  213  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  26.07 
 
 
727 aa  212  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  26.26 
 
 
727 aa  212  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  27.45 
 
 
740 aa  211  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  28.84 
 
 
772 aa  211  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
751 aa  211  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  26.05 
 
 
790 aa  209  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.16 
 
 
749 aa  209  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 
972 aa  208  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.71 
 
 
760 aa  208  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.92 
 
 
766 aa  208  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.55 
 
 
777 aa  208  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  26.86 
 
 
735 aa  208  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.57 
 
 
755 aa  207  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.69 
 
 
758 aa  207  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
755 aa  206  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  27.27 
 
 
760 aa  206  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.46 
 
 
751 aa  206  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.66 
 
 
783 aa  206  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  30.24 
 
 
864 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>