More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4604 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  100 
 
 
331 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  69.43 
 
 
315 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  66.04 
 
 
324 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  64.4 
 
 
346 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  61.85 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  61.85 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  61.85 
 
 
328 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  64.71 
 
 
324 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  62.73 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  63.58 
 
 
328 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  64.24 
 
 
342 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  62.62 
 
 
322 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  63.55 
 
 
322 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  56.59 
 
 
337 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  57.64 
 
 
320 aa  363  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  53.36 
 
 
318 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  48.73 
 
 
290 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  46.05 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  48 
 
 
290 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  45.52 
 
 
290 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  48.36 
 
 
290 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  46.91 
 
 
290 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  46.55 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  47.27 
 
 
290 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  46.55 
 
 
290 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  46.55 
 
 
290 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  46.08 
 
 
292 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  46.18 
 
 
290 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  46.18 
 
 
290 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  46.18 
 
 
290 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  45.82 
 
 
290 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  45.82 
 
 
290 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  45.82 
 
 
290 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  42.12 
 
 
286 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  40.27 
 
 
288 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  40.27 
 
 
288 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  41.55 
 
 
290 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  39.35 
 
 
287 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.52 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  40.48 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  40.48 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  40.48 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  39.59 
 
 
288 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  40.14 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  41.38 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.5 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  41.58 
 
 
293 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  41.67 
 
 
288 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  39.18 
 
 
288 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  40.36 
 
 
292 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 
305 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  40.89 
 
 
288 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  38.13 
 
 
293 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  37.1 
 
 
289 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  40.6 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  40.7 
 
 
284 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  38.83 
 
 
286 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  39.25 
 
 
288 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.03 
 
 
303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.73 
 
 
288 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  38.83 
 
 
286 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  38.49 
 
 
286 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  40.41 
 
 
279 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  38.49 
 
 
286 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  38.49 
 
 
286 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  39.38 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  41.67 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  38.44 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.18 
 
 
299 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  35.49 
 
 
290 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  38.55 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 
284 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  39.64 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  40.07 
 
 
286 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  37.97 
 
 
290 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  35.93 
 
 
293 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  37.59 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  40.67 
 
 
299 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  40.07 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.82 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  40.07 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.82 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.82 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  39.6 
 
 
282 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  36.69 
 
 
279 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  37.37 
 
 
288 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  36.09 
 
 
301 aa  178  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  39.73 
 
 
286 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  36.51 
 
 
311 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  37.05 
 
 
277 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  41.29 
 
 
287 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  39.43 
 
 
285 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  36.63 
 
 
303 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  42.02 
 
 
283 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>