285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4541 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  53.14 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  53.14 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  53.14 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  27.93 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.09 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.37 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.09 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 201 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 196 aa  94.4  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  24.02 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.71 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  22.47 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  24.1 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  28.67 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  32.67 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  32.67 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  28.67 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  31.55 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  31.68 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  28.39 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  25.81 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  31.68 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  31.68 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  42.35 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  31.68 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  25.14 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 329 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  24.47 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  25.65 
 
 		 274 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  28.46 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.59 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 248 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.59 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.59 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.59 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  24.59 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>