More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  100 
 
 
665 aa  1329    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.93 
 
 
633 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  43.23 
 
 
662 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  37.68 
 
 
631 aa  333  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.92 
 
 
673 aa  319  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  33.81 
 
 
653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  36.83 
 
 
647 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  37.5 
 
 
626 aa  301  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.67 
 
 
621 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 
626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  36.36 
 
 
615 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
616 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.79 
 
 
619 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  32.64 
 
 
618 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  34.28 
 
 
618 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
618 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  31.89 
 
 
604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.5 
 
 
623 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
616 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  33.55 
 
 
592 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  34.82 
 
 
615 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  32.25 
 
 
613 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  31.17 
 
 
623 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  30.91 
 
 
618 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.25 
 
 
603 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  32.18 
 
 
619 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.39 
 
 
613 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  32.1 
 
 
625 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.84 
 
 
603 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  31.88 
 
 
619 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  31.94 
 
 
606 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  35.88 
 
 
638 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.13 
 
 
600 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  31.77 
 
 
621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  33.61 
 
 
625 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  31.61 
 
 
621 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.32 
 
 
597 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  33.4 
 
 
621 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.26 
 
 
626 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.9 
 
 
611 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  33.98 
 
 
611 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  29.58 
 
 
611 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  35.48 
 
 
619 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.22 
 
 
605 aa  205  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.94 
 
 
614 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  30.62 
 
 
626 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.95 
 
 
595 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
599 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  23.75 
 
 
608 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
608 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.53 
 
 
633 aa  190  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.14 
 
 
566 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.67 
 
 
616 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  30.93 
 
 
605 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 
603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 
603 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.97 
 
 
627 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.72 
 
 
632 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
602 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  33.14 
 
 
610 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
611 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 
596 aa  177  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  33.07 
 
 
625 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  40.67 
 
 
500 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.06 
 
 
627 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  38.32 
 
 
701 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  31.86 
 
 
578 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.7 
 
 
753 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.12 
 
 
629 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  40.75 
 
 
962 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  25.97 
 
 
606 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.02 
 
 
591 aa  170  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.38 
 
 
585 aa  170  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.91 
 
 
641 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  41 
 
 
579 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.8 
 
 
587 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  40.3 
 
 
705 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  37.6 
 
 
727 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  41.63 
 
 
595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.16 
 
 
619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  44.02 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.75 
 
 
582 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.46 
 
 
582 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.32 
 
 
738 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  42.8 
 
 
750 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.13 
 
 
717 aa  167  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.67 
 
 
586 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.9 
 
 
634 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  36.4 
 
 
455 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.06 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  38.18 
 
 
600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  41.98 
 
 
618 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  32.31 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  31.54 
 
 
743 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  31.35 
 
 
619 aa  165  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.57 
 
 
601 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  35.98 
 
 
582 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.55 
 
 
639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 
586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>