More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4416 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  100 
 
 		 396 aa  780    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  42.89 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  35.01 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  36.15 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  37.37 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  36.93 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  34.55 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  32.38 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  33.85 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.87 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.85 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.33 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.18 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.32 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.05 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.7 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.33 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.71 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.87 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.33 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.97 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.6 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  34.13 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.79 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.73 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.25 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.51 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.49 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.25 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.74 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.93 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.73 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.77 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  23.86 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.98 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.99 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.71 
 
 		 404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.25 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  25.94 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.32 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.41 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.87 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.05 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  34.51 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.05 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.33 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.55 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  25.33 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.91 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.94 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.17 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.84 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.51 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.08 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.12 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.16 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.06 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  30.95 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.44 
 
 		 399 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.82 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.65 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.91 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  31.33 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.64 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.85 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  31.79 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.17 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.62 
 
 		 316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.79 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.05 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.23 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.02 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.41 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.67 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.67 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.52 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.67 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.67 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.67 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.48 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.43 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.64 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.48 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  31.48 
 
 		 392 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  32.93 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  30.94 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.57 
 
 		 503 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.06 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  29.06 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.04 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  31.2 
 
 		 448 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
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NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  32.71 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
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NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.81 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.59 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.23 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.22 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  26.22 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
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