More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
687 aa  1325    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  49.78 
 
 
680 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  49.4 
 
 
689 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  49.48 
 
 
682 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  47.71 
 
 
671 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  47.86 
 
 
698 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  42.78 
 
 
788 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  35.66 
 
 
787 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.2 
 
 
743 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  38.31 
 
 
639 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  31.05 
 
 
744 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  36.32 
 
 
653 aa  287  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  36.83 
 
 
657 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.85 
 
 
656 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  37.42 
 
 
652 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
646 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.14 
 
 
656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  35.1 
 
 
634 aa  257  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  47.88 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 
665 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  51.33 
 
 
619 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.11 
 
 
1085 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39.52 
 
 
725 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  41.32 
 
 
749 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.3 
 
 
662 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  32.63 
 
 
697 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  46.67 
 
 
444 aa  208  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  39.62 
 
 
432 aa  207  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  49.21 
 
 
450 aa  201  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  43.53 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  39.38 
 
 
450 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 
442 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  43.42 
 
 
725 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  45.06 
 
 
1193 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 
678 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  50.56 
 
 
445 aa  193  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  41.84 
 
 
448 aa  190  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 
450 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 
434 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 
466 aa  183  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  42.21 
 
 
448 aa  183  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  40.46 
 
 
478 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  32.48 
 
 
622 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.73 
 
 
441 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  38.43 
 
 
459 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
134 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.16 
 
 
299 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.01 
 
 
305 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  36.32 
 
 
352 aa  122  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  37.1 
 
 
387 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.26 
 
 
580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.08 
 
 
569 aa  117  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  29.5 
 
 
578 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.43 
 
 
228 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  27.48 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  26.24 
 
 
570 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  25.86 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  25.86 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  33.33 
 
 
326 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  28.79 
 
 
577 aa  99.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.56 
 
 
617 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 
443 aa  97.1  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  41.38 
 
 
771 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  42.75 
 
 
775 aa  94  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  35.87 
 
 
795 aa  94  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  42.66 
 
 
772 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 
784 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 
328 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.18 
 
 
781 aa  90.1  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 
332 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.3 
 
 
348 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  34.12 
 
 
789 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.07 
 
 
308 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  41.98 
 
 
766 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  40.15 
 
 
789 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.08 
 
 
451 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.03 
 
 
322 aa  87.8  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.75 
 
 
336 aa  87.4  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.15 
 
 
781 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 
698 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  37.79 
 
 
703 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.65 
 
 
800 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.65 
 
 
425 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.02 
 
 
493 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.45 
 
 
459 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  31.63 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
697 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  37.75 
 
 
771 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.45 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.47 
 
 
730 aa  86.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  32.39 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  39.39 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  39.39 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  28.89 
 
 
731 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  35.68 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 
428 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  84  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>