158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4324 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4324  trehalose-phosphatase  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.0213832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  40.84 
 
 
274 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  41.38 
 
 
274 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  35.66 
 
 
291 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  36.29 
 
 
279 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  36.55 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  34.13 
 
 
268 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  32.82 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
1225 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  31.05 
 
 
391 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.19 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  34.31 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  33.6 
 
 
1186 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  32.8 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  36.55 
 
 
238 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  33.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  35.75 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  27.24 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  35.4 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  32.94 
 
 
1327 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  30.08 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  30.85 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  33.8 
 
 
1215 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  33.8 
 
 
1215 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  33.8 
 
 
1215 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.68 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03441  Trehalose-6-phosphate phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6Y289]  28.86 
 
 
908 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.714188  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  35.64 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.22 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  32 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  27.9 
 
 
733 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.24 
 
 
745 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  34.98 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  33.54 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.49 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.1 
 
 
525 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  29.3 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  31.22 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.88 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.22 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  31.98 
 
 
417 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  32.16 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  32.17 
 
 
738 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  32.87 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  32.87 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  26.7 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  32.35 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  31.66 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02610  trehalose-phosphatase, putative  27.02 
 
 
989 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.58 
 
 
1314 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  32.21 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  29.9 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.9 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.44 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  31.58 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  33.17 
 
 
867 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  31.31 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  32.34 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  29.86 
 
 
346 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  31.02 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  31.31 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  35.85 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  32.34 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  30.09 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  31.02 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  32.34 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  28.26 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  31.66 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4022  trehalose-phosphatase  27 
 
 
724 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179404  normal  0.381996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2229  trehalose-phosphatase  27.8 
 
 
725 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  30.81 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  30.81 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.22 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  32.35 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.95 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.95 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.95 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  32.55 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>