More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4300 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  74.71 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  76.81 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  76.81 
 
 		 269 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  72.14 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  77.39 
 
 		 267 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  72.14 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  71.15 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  70.72 
 
 		 271 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  71.15 
 
 		 266 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  70.83 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  75.29 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  65.89 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  67.44 
 
 		 265 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  67.44 
 
 		 265 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  67.56 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  67.05 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  66.67 
 
 		 286 aa  342  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  68.87 
 
 		 290 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  63.08 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  64.34 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  66.15 
 
 		 275 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  64.43 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  66.14 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  62.35 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  62.07 
 
 		 260 aa  321  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  62.84 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  62.88 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4085  ABC transporter related  68.11 
 
 		 264 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0156292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  60.38 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0646  ABC transporter related protein  65.64 
 
 		 270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  64.23 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  60.78 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 285 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 264 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 264 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 271 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  60.55 
 
 		 280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  59.39 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  58.69 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  56.64 
 
 		 282 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  58.21 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  56.98 
 
 		 274 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  53.38 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10180  ferric enterobactin transport protein FepC  67.32 
 
 		 265 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0235385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  57.65 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.81 
 
 		 258 aa  295  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 277 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  52.16 
 
 		 269 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  52.16 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  52.73 
 
 		 267 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  53.36 
 
 		 269 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  53.58 
 
 		 278 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  51.97 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.2 
 
 		 625 aa  288  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5111  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 262 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  59.45 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3783  ABC transporter related protein  62.99 
 
 		 266 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 260 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2444  ferric enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein FepC  55.6 
 
 		 272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3186  ferric enterobactin ABC transporter ATP-binding protein FepC  55.6 
 
 		 272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0584724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.57 
 
 		 273 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2543  ABC transporter related  55.6 
 
 		 272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  52.82 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  54.18 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  49.28 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  48.85 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.57 
 
 		 273 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  52.17 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  50.97 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  55.36 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 270 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2720  ABC transporter related  56.92 
 
 		 261 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.78 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  51.94 
 
 		 274 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  51.52 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  59.38 
 
 		 270 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  57.92 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  53.73 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  48.5 
 
 		 286 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>