More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4265 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
542 aa  1061    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  54.76 
 
 
534 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  50.37 
 
 
546 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  50.9 
 
 
488 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.69 
 
 
545 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.81 
 
 
531 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.26 
 
 
508 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.2 
 
 
509 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  47.87 
 
 
531 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  43.32 
 
 
528 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  43.12 
 
 
531 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  42.61 
 
 
554 aa  379  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.6 
 
 
525 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.57 
 
 
511 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.8 
 
 
512 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  45.82 
 
 
523 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  43.16 
 
 
512 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.16 
 
 
512 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.16 
 
 
512 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.39 
 
 
505 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  43.85 
 
 
570 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.51 
 
 
520 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.75 
 
 
515 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.02 
 
 
505 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.43 
 
 
521 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  50.7 
 
 
608 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.92 
 
 
508 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  40.28 
 
 
538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  42.91 
 
 
524 aa  319  7.999999999999999e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.19 
 
 
552 aa  313  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  49.85 
 
 
501 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.5 
 
 
532 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.92 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  39.93 
 
 
489 aa  174  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  38.95 
 
 
528 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.41 
 
 
512 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
505 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.82 
 
 
400 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.44 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
403 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 
402 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 
403 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.22 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  36.04 
 
 
414 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.32 
 
 
376 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.79 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.14 
 
 
369 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.18 
 
 
370 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.89 
 
 
363 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.13 
 
 
361 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
426 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 
401 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.97 
 
 
406 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.49 
 
 
408 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.03 
 
 
415 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.53 
 
 
412 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.82 
 
 
431 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 
407 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 
402 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.41 
 
 
417 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 
445 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.02 
 
 
199 aa  98.6  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.63 
 
 
410 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.73 
 
 
369 aa  98.2  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.89 
 
 
369 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.31 
 
 
359 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  26.9 
 
 
409 aa  97.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.94 
 
 
406 aa  96.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.34 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  27.3 
 
 
369 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.36 
 
 
416 aa  94  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.57 
 
 
335 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
429 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.35 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 
461 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  29.64 
 
 
367 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
270 aa  91.3  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  26.96 
 
 
407 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  28.72 
 
 
409 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.46 
 
 
209 aa  90.1  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.11 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.98 
 
 
200 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.09 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.15 
 
 
402 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.15 
 
 
406 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.7 
 
 
418 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  30.67 
 
 
414 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.7 
 
 
418 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  24.94 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  28.9 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.74 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.74 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  30.49 
 
 
424 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.04 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>