174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4251 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
528 aa  1061    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  52.41 
 
 
558 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  51.22 
 
 
525 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.78 
 
 
515 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.59 
 
 
584 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.49 
 
 
593 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.25 
 
 
816 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.13 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.24 
 
 
500 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.96 
 
 
820 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.65 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 
553 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.79 
 
 
473 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.84 
 
 
762 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.39 
 
 
655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.58 
 
 
479 aa  282  9e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.82 
 
 
618 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.23 
 
 
542 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 
777 aa  271  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
795 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 
605 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.25 
 
 
613 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  30.77 
 
 
795 aa  259  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.66 
 
 
526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.52 
 
 
618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  32.15 
 
 
776 aa  253  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 
772 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
834 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.6 
 
 
534 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 
634 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.63 
 
 
546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.19 
 
 
609 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
481 aa  240  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.08 
 
 
613 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.79 
 
 
790 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 
736 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 
779 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 
765 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.79 
 
 
760 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.25 
 
 
905 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.32 
 
 
779 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
775 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 
766 aa  233  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 
505 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  30.35 
 
 
639 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 
812 aa  230  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.26 
 
 
639 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.28 
 
 
665 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 
812 aa  227  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
525 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.73 
 
 
529 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 
527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
781 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.73 
 
 
785 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.75 
 
 
549 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  32.22 
 
 
637 aa  216  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 
821 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.39 
 
 
549 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 
852 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 
774 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.19 
 
 
547 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
639 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.52 
 
 
543 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
447 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.19 
 
 
534 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
422 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.8 
 
 
636 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.13 
 
 
602 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 
628 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
636 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.4 
 
 
688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 
639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
866 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 
858 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.56 
 
 
469 aa  194  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 
493 aa  193  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
683 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
627 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.25 
 
 
1140 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.33 
 
 
614 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 
673 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.82 
 
 
545 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.91 
 
 
504 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.39 
 
 
673 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
913 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.2 
 
 
910 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.86 
 
 
863 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.39 
 
 
915 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
794 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 
919 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.6 
 
 
688 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.65 
 
 
518 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.98 
 
 
913 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.5 
 
 
868 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.96 
 
 
676 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  25.93 
 
 
883 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.57 
 
 
881 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 
811 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>