More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4216 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 320 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  42.44 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  39.86 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  42.91 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  39.13 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  37.09 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  37.83 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  34.98 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  30.62 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  31.7 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  34.72 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.18 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  31.32 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.58 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.33 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.19 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.49 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1793  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.86 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1993  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.86 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.16 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.22 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.93 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4103  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.07 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.84 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.19 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.08 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.52 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.04 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.92 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  25.87 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.78 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.83 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.41 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.18 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.59 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  30.19 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.72 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  30.4 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.59 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.18 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.74 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00000952381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  30.19 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>