More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4154 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 516 aa  1004    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.29 
 
 		 522 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  53.41 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 		 469 aa  356  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 527 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.45 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.11 
 
 		 522 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.42 
 
 		 511 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 500 aa  289  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 505 aa  266  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  35.79 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.3 
 
 		 510 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.27 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 574 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 553 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.28 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 512 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.17 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 587 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 529 aa  243  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 516 aa  242  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.06 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 487 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 532 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.48 
 
 		 502 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.69 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 508 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  38.25 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.85 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 788 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.65 
 
 		 458 aa  230  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.9 
 
 		 471 aa  229  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 465 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 513 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 488 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.16 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.08 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.99 
 
 		 551 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.23 
 
 		 582 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 500 aa  223  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  34.14 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 		 569 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>