26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4136 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  100 
 
 
544 aa  1110    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  55.19 
 
 
552 aa  591  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.53 
 
 
795 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  46.27 
 
 
569 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  41.61 
 
 
707 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  31.99 
 
 
1010 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  33.25 
 
 
435 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  31.5 
 
 
423 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  30.17 
 
 
473 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  48.04 
 
 
788 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  47.06 
 
 
777 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  44.74 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  44.74 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  44.74 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  38.68 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  49.47 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.32 
 
 
190 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  35.29 
 
 
270 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38 
 
 
173 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  46.97 
 
 
852 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  31.13 
 
 
516 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  39.71 
 
 
140 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  32.76 
 
 
388 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>