39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3913 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.46 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  29.79 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.2 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.16 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.86 
 
 		 153 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 182 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.54 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  24.16 
 
 		 1027 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.25 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.11 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.49 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.73 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.14 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.97 
 
 		 154 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.74 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  26.97 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26 
 
 		 148 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.82 
 
 		 254 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  25.16 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.14 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.66 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.56 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.48 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.15 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.94 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.7 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.38 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>