90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
323 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  64.26 
 
 
327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  63.86 
 
 
315 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  60.62 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.48 
 
 
322 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  50.62 
 
 
318 aa  318  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  50.65 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  46.08 
 
 
313 aa  300  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  47.1 
 
 
342 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.11 
 
 
315 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  43.33 
 
 
337 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  42.72 
 
 
324 aa  248  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  42.61 
 
 
320 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.77 
 
 
330 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.26 
 
 
316 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  39.47 
 
 
303 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  36.72 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.25 
 
 
320 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  37.62 
 
 
324 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  38.51 
 
 
328 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  38.35 
 
 
291 aa  198  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.4 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.24 
 
 
309 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  38.35 
 
 
291 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.26 
 
 
303 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.78 
 
 
307 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.36 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  36.94 
 
 
303 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.84 
 
 
307 aa  188  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  36.12 
 
 
303 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  35.32 
 
 
306 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  34.94 
 
 
306 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 
306 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.57 
 
 
307 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.93 
 
 
306 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  37.04 
 
 
291 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  36.84 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  35.36 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  34.57 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.2 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  36.09 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.3 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.57 
 
 
305 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.29 
 
 
306 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.12 
 
 
306 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.57 
 
 
305 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  34.94 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 
305 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.38 
 
 
307 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  35.02 
 
 
307 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  36.1 
 
 
306 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.25 
 
 
304 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 
299 aa  175  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.72 
 
 
255 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.56 
 
 
320 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.56 
 
 
320 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.71 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.32 
 
 
277 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  33.45 
 
 
314 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  32.08 
 
 
319 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 
298 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.66 
 
 
293 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.54 
 
 
296 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  35.92 
 
 
297 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35.83 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  32.97 
 
 
294 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  33.46 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.6 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  24.14 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  24.92 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  24.29 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.35 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  23.97 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.81 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  22.82 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.57 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.52 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  22.15 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.41 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  23.18 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.18 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  22.52 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1595  hypothetical protein  78.57 
 
 
101 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  21.99 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>