156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3834 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 399 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  34.66 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 		 497 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.64 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  32.3 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  32.3 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  30.36 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  29.84 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.41 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.83 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  29.27 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  33.5 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  33.91 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.87 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  38.89 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  42.57 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  38.12 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  36.05 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.72 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  31.16 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  33.77 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  44.3 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  32.33 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  34.95 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  32.33 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  44.3 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  41.07 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  29.91 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  33.12 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  34.36 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  32.12 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  27.59 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.22 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  29.09 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.78 
 
 		 564 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 		 552 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.18 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.37 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.04 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  32.95 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25.71 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  27.73 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  32.91 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.1 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  33.06 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  29.49 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  31.33 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  27.59 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.49 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  55.56 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.14 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  31.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  34.15 
 
 		 491 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  36 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  34.86 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  28.3 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  37.36 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.48 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  30.87 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  32.9 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  32.9 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  32.9 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  25.95 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.8 
 
 		 444 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  36.11 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  24.59 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.04 
 
 		 446 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  22.67 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  26.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.62 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.52 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  29.8 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  31.34 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  34.07 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  31.02 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  36.9 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.11 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  40.7 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  32.6 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>