More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3785 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  59.25 
 
 		 574 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  59.36 
 
 		 579 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  59.61 
 
 		 574 aa  695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  55.75 
 
 		 580 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  61.11 
 
 		 569 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  57.42 
 
 		 576 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  59.25 
 
 		 579 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  58.82 
 
 		 574 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  58.82 
 
 		 574 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  59.54 
 
 		 579 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  59.27 
 
 		 579 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  100 
 
 		 954 aa  1904    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  59 
 
 		 579 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  57.12 
 
 		 574 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  59.27 
 
 		 579 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  59.27 
 
 		 579 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  56.34 
 
 		 578 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  55.58 
 
 		 582 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  55.4 
 
 		 582 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  56.56 
 
 		 578 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  55.04 
 
 		 578 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  54.05 
 
 		 591 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  54.72 
 
 		 583 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  55.07 
 
 		 580 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.36 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  36.06 
 
 		 573 aa  324  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.42 
 
 		 574 aa  252  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.32 
 
 		 579 aa  205  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.51 
 
 		 556 aa  202  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 		 594 aa  191  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.59 
 
 		 563 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.68 
 
 		 566 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.22 
 
 		 590 aa  154  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.86 
 
 		 563 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.87 
 
 		 579 aa  144  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  25.96 
 
 		 568 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.31 
 
 		 635 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 587 aa  131  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.69 
 
 		 659 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.21 
 
 		 591 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.26 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.68 
 
 		 566 aa  125  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.49 
 
 		 540 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.11 
 
 		 608 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.19 
 
 		 634 aa  119  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.07 
 
 		 627 aa  118  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.39 
 
 		 542 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.53 
 
 		 542 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.71 
 
 		 564 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.3 
 
 		 577 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.42 
 
 		 584 aa  115  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.79 
 
 		 629 aa  115  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  24.92 
 
 		 632 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.16 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  27.47 
 
 		 863 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.27 
 
 		 635 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.08 
 
 		 604 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  27.76 
 
 		 545 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.88 
 
 		 596 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.1 
 
 		 622 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.27 
 
 		 607 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  26.24 
 
 		 522 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.65 
 
 		 583 aa  111  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.84 
 
 		 625 aa  111  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.04 
 
 		 612 aa  110  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  27.51 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.43 
 
 		 622 aa  110  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  27.03 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.73 
 
 		 603 aa  109  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  25.57 
 
 		 528 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.87 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.44 
 
 		 607 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.08 
 
 		 605 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.43 
 
 		 629 aa  108  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.65 
 
 		 591 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.08 
 
 		 605 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.96 
 
 		 605 aa  106  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.92 
 
 		 605 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  24.32 
 
 		 637 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 		 596 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.88 
 
 		 604 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.75 
 
 		 583 aa  105  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  24.91 
 
 		 647 aa  104  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.35 
 
 		 562 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.31 
 
 		 611 aa  104  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.39 
 
 		 608 aa  104  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.04 
 
 		 595 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  25.13 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.17 
 
 		 582 aa  103  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.04 
 
 		 612 aa  103  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.68 
 
 		 590 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.05 
 
 		 624 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.39 
 
 		 610 aa  102  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.23 
 
 		 542 aa  101  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.73 
 
 		 673 aa  101  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  26.31 
 
 		 576 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2559  L-aspartate oxidase  26.75 
 
 		 591 aa  101  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.617857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.78 
 
 		 588 aa  100  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.96 
 
 		 597 aa  101  9e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.8 
 
 		 612 aa  101  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>