104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3738 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
212 aa  413  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  58.74 
 
 
209 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  54.23 
 
 
222 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  57.92 
 
 
206 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  46.15 
 
 
215 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  43.41 
 
 
209 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.93 
 
 
210 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  55.79 
 
 
132 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  33.33 
 
 
190 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  36.9 
 
 
208 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.71 
 
 
190 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.07 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.87 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.83 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.5 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.4 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  31.4 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.74 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.86 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  30 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.33 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.88 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.87 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.68 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.63 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
286 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  31.28 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.73 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.98 
 
 
228 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.41 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.77 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.79 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.15 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.5 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.34 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.98 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.37 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.35 
 
 
248 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.57 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.53 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  33.7 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  31.68 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.01 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.44 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.67 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.19 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.56 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.8 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.17 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  27.91 
 
 
220 aa  52  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.71 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.64 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.45 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.32 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  28.35 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.43 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  27.33 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.6 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  31.01 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  33.09 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  30.48 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.49 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  27.46 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  29.37 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1100  putative reductase  53.19 
 
 
67 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0134803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.91 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.27 
 
 
236 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.11 
 
 
225 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.22 
 
 
217 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.84 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.92 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  32.43 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  28.5 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.46 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.89 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.46 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  29.46 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.82 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.16 
 
 
289 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.82 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  32.18 
 
 
346 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.19 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  30.95 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.71 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.28 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  25.17 
 
 
222 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>