214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3682 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  65.19 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  55.96 
 
 		 280 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  51.4 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  53.36 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  52.88 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  52.8 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  51.38 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  52.8 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  51.03 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  52.45 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  49.03 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  46.6 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  48.81 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  48.78 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 304 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  49.5 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  48.11 
 
 		 287 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  47.92 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  46.39 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  49.13 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  47.04 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  49.5 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  46.26 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  46.13 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  41.41 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  43 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  41.64 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  43.01 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  41.28 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  41.3 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  40.42 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  44.04 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  40.27 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  40.42 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.74 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  41.1 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  40.15 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  40.5 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  37.05 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41.44 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  36.3 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  34.88 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.87 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  38.06 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.74 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.87 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 284 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.01 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  36.95 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  36.1 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>