50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3640 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 578 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 1119 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 702 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  41.8 
 
 		 994 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 639 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  33.83 
 
 		 665 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  37.36 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1123 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  34.36 
 
 		 830 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.23 
 
 		 732 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  28.77 
 
 		 1087 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1147 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1437 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.88 
 
 		 2145 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 878 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.43 
 
 		 810 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1581 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1285 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1212 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1404 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.89 
 
 		 672 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1550 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  29.89 
 
 		 762 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 1186 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 1476 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 3560 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 		 997 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.8 
 
 		 626 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 573 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 1363 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 		 632 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 927 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.15 
 
 		 1007 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  28.96 
 
 		 724 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.19 
 
 		 887 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1082 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.1 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 4079 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  27.83 
 
 		 596 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 3035 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1519 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 4489 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.51 
 
 		 1694 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>