32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3638 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  53.33 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  35.88 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  28.01 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  34.87 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  32.03 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  31.18 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  37.6 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.18 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.35 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>