More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
927 aa  1800    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  48.45 
 
 
928 aa  710    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  48.34 
 
 
892 aa  625  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  39.68 
 
 
884 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.06 
 
 
923 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  36.08 
 
 
955 aa  347  8.999999999999999e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.73 
 
 
923 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 
909 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.5 
 
 
922 aa  334  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.14 
 
 
919 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.37 
 
 
920 aa  318  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.5 
 
 
934 aa  315  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 
911 aa  300  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
950 aa  291  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 
929 aa  290  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 
938 aa  284  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.44 
 
 
925 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 
919 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 
928 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.74 
 
 
879 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42 
 
 
930 aa  250  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 
917 aa  237  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  44.03 
 
 
940 aa  231  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  42.17 
 
 
928 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
953 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 
918 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
937 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  43.68 
 
 
937 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  41.94 
 
 
961 aa  209  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  43.44 
 
 
937 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 
946 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 
889 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.65 
 
 
905 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 
903 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 
894 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  40.3 
 
 
884 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
936 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 
923 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 
913 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  45.15 
 
 
240 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 
927 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 
940 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 
915 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.57 
 
 
923 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
881 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
881 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  40.15 
 
 
904 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 
916 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
876 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 
919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 
919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  38.92 
 
 
916 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35 
 
 
929 aa  111  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.9 
 
 
995 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.62 
 
 
913 aa  109  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 
897 aa  109  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  26.99 
 
 
910 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 
919 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.23 
 
 
900 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 
910 aa  99.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  46.34 
 
 
913 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 
894 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
940 aa  92.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.45 
 
 
929 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 
946 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  28.53 
 
 
921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
967 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
1000 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
921 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 
921 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  43.7 
 
 
893 aa  87.8  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
189 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
973 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 
1064 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 
1029 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.04 
 
 
992 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
998 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
236 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 
997 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.93 
 
 
1055 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  43.09 
 
 
921 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 
983 aa  81.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.17 
 
 
1006 aa  80.9  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.46 
 
 
1075 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
959 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 
907 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 
947 aa  79  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.7 
 
 
1150 aa  77.8  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  36.72 
 
 
977 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.03 
 
 
947 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 
951 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 
835 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.39 
 
 
1015 aa  73.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 
952 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.59 
 
 
1117 aa  72  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.26 
 
 
1051 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
881 aa  71.2  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  44.74 
 
 
963 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>