61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3602 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 		 434 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  44.18 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  45.68 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  44.14 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.52 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  40.49 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  33.43 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  32.29 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  41.85 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  33.51 
 
 		 870 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.48 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  30.2 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.81 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.48 
 
 		 448 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.38 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  41.1 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  42.68 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  38.68 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  36.32 
 
 		 330 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.34 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  33.6 
 
 		 456 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.89 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  25.41 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  37.5 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  37.07 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  40.56 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  35.94 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.04 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  31.23 
 
 		 329 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  31.23 
 
 		 329 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  31.23 
 
 		 329 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  27.15 
 
 		 548 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  29.67 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 1128 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  28.57 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  31.7 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  26.92 
 
 		 655 aa  83.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  35.17 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  31.38 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 1209 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  32.35 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  29.26 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  27.43 
 
 		 743 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  25.86 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.54 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  24.12 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.67 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  24.43 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  22.77 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.36 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.49 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  24.6 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.27 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  32.81 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  24.45 
 
 		 791 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  23.93 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.13 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.13 
 
 		 588 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>