More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3596 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  57.98 
 
 
312 aa  368  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 
324 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.4 
 
 
311 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.19 
 
 
334 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
304 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
342 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258358  normal  0.837912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.03 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5399  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.18 
 
 
300 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000377109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
312 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
300 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
337 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
319 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.54 
 
 
296 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
299 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
317 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
292 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
318 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.415839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
317 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
305 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  37 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.42 
 
 
318 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3555  putative ABC transporter permease protein  34.51 
 
 
317 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
289 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
314 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
299 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
337 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 
295 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
338 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
330 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
286 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
286 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
310 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
307 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.55 
 
 
307 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
312 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
298 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
311 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421015  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
290 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.37 
 
 
318 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
296 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3121  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
317 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
319 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
315 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
427 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
309 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
320 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
314 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
316 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
315 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
295 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
315 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
365 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
326 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
312 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
314 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
317 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
297 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.95 
 
 
294 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
304 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
310 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
325 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
321 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
306 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
310 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9092  trehalose/maltose transport inner membrane protein  31.43 
 
 
326 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309735  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.79 
 
 
324 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
435 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7724  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.53 
 
 
323 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0243999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
311 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
312 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
317 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
312 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
316 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
332 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
316 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
328 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
309 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0434884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
310 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0803077  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
311 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>