38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3583 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
357 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  49.01 
 
 
358 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  48.6 
 
 
368 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 
843 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  43.99 
 
 
377 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  39.3 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  40.39 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  42.66 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  40.28 
 
 
383 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  41.29 
 
 
1077 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  37.04 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  36.47 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  36.75 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  37.29 
 
 
358 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  36.47 
 
 
358 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  38.42 
 
 
955 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  39.53 
 
 
372 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.96 
 
 
734 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  38.94 
 
 
695 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  39.45 
 
 
686 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.72 
 
 
734 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  35.58 
 
 
381 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 
787 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 
1247 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  36.34 
 
 
317 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  36.34 
 
 
317 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.8 
 
 
957 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  32.69 
 
 
361 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
1082 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
882 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  38.01 
 
 
751 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  38.01 
 
 
751 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  31.28 
 
 
381 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  23.29 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  62.79 
 
 
47 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3361  hypothetical protein  22.07 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.148862 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  24.41 
 
 
391 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>