More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3465 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
729 aa  1483    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.93 
 
 
809 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
369 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  44.16 
 
 
399 aa  237  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  43.4 
 
 
381 aa  237  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  45.3 
 
 
388 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  42.37 
 
 
360 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  40.48 
 
 
406 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  40.31 
 
 
374 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  41.91 
 
 
343 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  41 
 
 
389 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  38.86 
 
 
398 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  38.74 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.32 
 
 
407 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  41.14 
 
 
357 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  37.14 
 
 
388 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.11 
 
 
381 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  42.67 
 
 
377 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  38.71 
 
 
405 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  39.6 
 
 
394 aa  197  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  37.25 
 
 
404 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 
369 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  36.83 
 
 
401 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 
394 aa  183  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 
442 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  38.19 
 
 
353 aa  180  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  38.82 
 
 
365 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 
391 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  32.22 
 
 
390 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  35.53 
 
 
367 aa  172  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.31 
 
 
360 aa  159  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.83 
 
 
408 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
407 aa  148  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 
363 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.88 
 
 
388 aa  144  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
379 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  34.56 
 
 
392 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  33.61 
 
 
410 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 
377 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  34.08 
 
 
384 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.68 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 
999 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 
999 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 
999 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52.55 
 
 
571 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.92 
 
 
342 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.13 
 
 
1448 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  31.39 
 
 
382 aa  130  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  34.14 
 
 
1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 
366 aa  129  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.64 
 
 
392 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
387 aa  128  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  29.65 
 
 
387 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 
383 aa  127  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 
374 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
407 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 
374 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.22 
 
 
2170 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  28.7 
 
 
410 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
428 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
415 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  50.75 
 
 
452 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
428 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  38.31 
 
 
456 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.02 
 
 
399 aa  122  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
432 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 
413 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
392 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.14 
 
 
375 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  37.09 
 
 
455 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 
377 aa  121  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.88 
 
 
455 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  38.19 
 
 
455 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.88 
 
 
455 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.98 
 
 
674 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  37.44 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  36.97 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.92 
 
 
387 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 
385 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36.53 
 
 
377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 
402 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  36.32 
 
 
455 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  31.97 
 
 
382 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
385 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.82 
 
 
456 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.42 
 
 
385 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 
366 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  34.69 
 
 
394 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.56 
 
 
743 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 
387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  31.18 
 
 
384 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  35.32 
 
 
459 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.94 
 
 
953 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>