More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3329 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 830 aa  1602    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 797 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.18 
 
 		 847 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.83 
 
 		 424 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.93 
 
 		 532 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 		 309 aa  138  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  36.4 
 
 		 688 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.33 
 
 		 692 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.19 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.4 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.2 
 
 		 1051 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2800  putative PAS/PAC sensor protein  26.53 
 
 		 783 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  35.55 
 
 		 574 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 607 aa  118  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 		 865 aa  118  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.34 
 
 		 817 aa  118  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.83 
 
 		 453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.33 
 
 		 637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 		 693 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 754 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.71 
 
 		 618 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 		 614 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.19 
 
 		 579 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  37.22 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  35.86 
 
 		 932 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  37.39 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 		 570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 		 427 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 		 1017 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.43 
 
 		 553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 		 692 aa  111  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.43 
 
 		 502 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.19 
 
 		 525 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.39 
 
 		 828 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.42 
 
 		 1045 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 776 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 		 594 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 395 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.68 
 
 		 851 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.79 
 
 		 684 aa  108  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.31 
 
 		 573 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  38.86 
 
 		 738 aa  108  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.02 
 
 		 529 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.51 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.83 
 
 		 450 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1370 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  35.11 
 
 		 685 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.31 
 
 		 775 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 		 544 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.41 
 
 		 536 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1385 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.78 
 
 		 591 aa  105  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 		 770 aa  104  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.57 
 
 		 750 aa  104  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.38 
 
 		 952 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 1361 aa  104  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 		 1039 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1711 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  37.62 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.5 
 
 		 697 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 649 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  35.41 
 
 		 547 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 		 637 aa  102  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1390 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1390 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1390 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.35 
 
 		 616 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 		 956 aa  100  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 723 aa  100  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  31.12 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.73 
 
 		 583 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 652 aa  99.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  32.53 
 
 		 670 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 546 aa  99.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 1248 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 765 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.33 
 
 		 1082 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.38 
 
 		 644 aa  99  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 409 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.93 
 
 		 477 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 		 700 aa  98.6  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.18 
 
 		 753 aa  98.6  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 		 521 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  37.5 
 
 		 467 aa  97.8  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  30.24 
 
 		 537 aa  97.8  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  37.91 
 
 		 757 aa  97.8  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  31.02 
 
 		 745 aa  97.8  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.61 
 
 		 743 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  35.03 
 
 		 488 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 744 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  38.14 
 
 		 376 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.57 
 
 		 775 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 		 410 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  28.15 
 
 		 463 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.4 
 
 		 613 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  28.68 
 
 		 460 aa  96.3  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.82 
 
 		 688 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  35.17 
 
 		 583 aa  95.9  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>