67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3287 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  68.69 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  66.13 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  66.35 
 
 		 324 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  52.38 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  53.04 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  50.48 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  49.52 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  49.04 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  46.67 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.85 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  38.89 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.68 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.16 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  26.25 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.69 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.78 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  29.07 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  36.13 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  33.78 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.55 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  30.07 
 
 		 567 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.13 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  32.28 
 
 		 601 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  33.61 
 
 		 568 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  22.49 
 
 		 600 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  22.49 
 
 		 600 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.88 
 
 		 430 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  29.22 
 
 		 464 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.51 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.52 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.51 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.44 
 
 		 551 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.41 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.68 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.16 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  29.56 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30.77 
 
 		 572 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  33.04 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  25.42 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  30.48 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  31.45 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.78 
 
 		 547 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  32.92 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 		 567 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  34.41 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  34.65 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  36 
 
 		 352 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  30.99 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  34.23 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  30.82 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  26.98 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  26.83 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  33.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.33 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  28.1 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  32.54 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  33.06 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  34.13 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.77 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  29.44 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  48.84 
 
 		 474 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  25.51 
 
 		 546 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>