More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3224 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
399 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  54.66 
 
 
408 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  53.28 
 
 
408 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  51.9 
 
 
408 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  50.38 
 
 
402 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  47.76 
 
 
399 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  42.68 
 
 
393 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  39.8 
 
 
392 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  40.56 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  36.34 
 
 
408 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  42.26 
 
 
423 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  38.13 
 
 
384 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  39.84 
 
 
392 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  37.08 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.83 
 
 
382 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.71 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  29.41 
 
 
421 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  29.93 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.97 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  34.19 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.7 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.5 
 
 
407 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
377 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 
376 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.3 
 
 
390 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  27.62 
 
 
397 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
367 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.13 
 
 
386 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
384 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  27.33 
 
 
397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 
419 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 
376 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  27.33 
 
 
397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  27.33 
 
 
397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 
410 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  27.33 
 
 
397 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.33 
 
 
379 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.46 
 
 
377 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.57 
 
 
403 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
385 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.97 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 
309 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.71 
 
 
385 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  25.64 
 
 
397 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.55 
 
 
397 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.72 
 
 
377 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  28.18 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.22 
 
 
373 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  32.15 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.53 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.4 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.75 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.22 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  29.68 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.96 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.47 
 
 
376 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.74 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.83 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.07 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.25 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  29.94 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
425 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  26.36 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.04 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 
376 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.86 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.48 
 
 
364 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.04 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.33 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.17 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  25.92 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.27 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  31.06 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  27.59 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  32.5 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.55 
 
 
376 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.94 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.06 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.15 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  25.78 
 
 
360 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.64 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.23 
 
 
371 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>