More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3215  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000943749  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  45.64 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3128  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  37.56 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  33.95 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  33.71 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  33.71 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  33.71 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  33.71 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  33.71 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  36.87 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  33.71 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  33.71 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  37.1 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.57 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4124  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  33.83 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.16 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  33.04 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4893  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0696189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  35.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  36.04 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  35.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  36.04 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  36.04 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  35.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  35.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  33.03 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>