More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  79.7 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  75.17 
 
 		 150 aa  216  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  75.56 
 
 		 160 aa  214  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  74.47 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  75.74 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  78.03 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  78.03 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  78.03 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  72.86 
 
 		 148 aa  205  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  75.59 
 
 		 149 aa  203  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  72.93 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  70.83 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  76.86 
 
 		 153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  73.94 
 
 		 147 aa  196  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  71.63 
 
 		 151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  73.48 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  75.21 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  75.37 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  67.42 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  74.14 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  75.63 
 
 		 148 aa  173  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  65.15 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  62.31 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  69.37 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  63.25 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  49.62 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  52.17 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  50.88 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  44.63 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  48.31 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  45.38 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.62 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 168 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 513 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.36 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  33.91 
 
 		 304 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  37.5 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  37.5 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 291 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 300 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 286 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  34.95 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 340 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 265 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 293 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 298 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>