163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3169 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
346 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  50.91 
 
 
340 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  50 
 
 
340 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 
343 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  47.56 
 
 
348 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  47.42 
 
 
347 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  48.33 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  46.81 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  48.34 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  44.88 
 
 
350 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  48.05 
 
 
343 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  45.4 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.4 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  43.2 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  45.43 
 
 
339 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  44.07 
 
 
334 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  44.24 
 
 
334 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  43.35 
 
 
406 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  47.71 
 
 
343 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  47.71 
 
 
343 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  47.71 
 
 
343 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  44.24 
 
 
334 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  44.24 
 
 
334 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  42.12 
 
 
352 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  44.51 
 
 
347 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  43.9 
 
 
367 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  46.34 
 
 
335 aa  252  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
326 aa  235  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  38.42 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.17 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.56 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.56 
 
 
330 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  34.68 
 
 
353 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  36.79 
 
 
346 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  54.49 
 
 
281 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  33.05 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  34.55 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  37.15 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  36.33 
 
 
335 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.39 
 
 
321 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  35.19 
 
 
320 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  36.25 
 
 
320 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  35.92 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.54 
 
 
321 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  33.8 
 
 
339 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.04 
 
 
318 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  36.56 
 
 
316 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  36.3 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  36.57 
 
 
306 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  34.63 
 
 
349 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  29.48 
 
 
330 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  35.17 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  36.01 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  36.01 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  36.01 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
352 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  35.21 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.86 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 
321 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  36.84 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  30.43 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.63 
 
 
341 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.64 
 
 
327 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.4 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.81 
 
 
350 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 
318 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
343 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.81 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  28.33 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  30.65 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  32.89 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.88 
 
 
300 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.63 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.64 
 
 
317 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 
323 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.57 
 
 
337 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  32.13 
 
 
356 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  35.36 
 
 
323 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  29.79 
 
 
316 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.74 
 
 
311 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 
344 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  32.45 
 
 
381 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.93 
 
 
337 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  33.96 
 
 
311 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  35.07 
 
 
233 aa  99.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  36.47 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  36.47 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  30.21 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  33.55 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>