More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3098 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  100 
 
 		 188 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  70.33 
 
 		 180 aa  257  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  70.95 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  65.93 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  67.21 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  67.21 
 
 		 182 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  66.11 
 
 		 181 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  65.54 
 
 		 186 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  64.2 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  60.66 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  58.89 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  65.38 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  56.44 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.99 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  64.41 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  56.44 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  56.96 
 
 		 161 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  56.17 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  52.44 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  55.35 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  53.89 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  54.32 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  52.76 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  52.2 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  54.72 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  51.57 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.28 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  48.1 
 
 		 162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.87 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  50.32 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.31 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  47.1 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.62 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  42.33 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  40.76 
 
 		 162 aa  138  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  48.63 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.32 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.18 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.44 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  46.63 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.55 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  42.86 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  46.99 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  41.14 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  44.6 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  40.61 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  43.11 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  43.21 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  45.57 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  43.48 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  40.91 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.71 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.44 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  42.33 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.57 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  44.52 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.24 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  38.22 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  39.87 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.24 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.47 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  44.44 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  40.44 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  40.44 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  40.44 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  43.97 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  41.61 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  38.59 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  37.29 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.86 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.14 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.25 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.25 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  37.7 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.62 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.72 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.76 
 
 		 156 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  42.07 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  39.36 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.53 
 
 		 215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.01 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  42.14 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.01 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.41 
 
 		 154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.79 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  40.12 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  41.38 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.54 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  39.26 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  43.57 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  42.07 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>