30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2831 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  26.9 
 
 
404 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  31.06 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.22 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 
528 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.69 
 
 
386 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  26.32 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.24 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  27.13 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  27.13 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  29.85 
 
 
545 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.56 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  29.85 
 
 
545 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  30.25 
 
 
196 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  26.67 
 
 
758 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.17 
 
 
577 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.03 
 
 
481 aa  44.3  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  22.7 
 
 
294 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 
393 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.68 
 
 
545 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  22.37 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  25.5 
 
 
543 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  24.52 
 
 
585 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  35.53 
 
 
575 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.35 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  24.81 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  30.6 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  32.71 
 
 
487 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.81 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.86 
 
 
534 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>