186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2738 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  100 
 
 
468 aa  947    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  67.15 
 
 
472 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  46.72 
 
 
289 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  45.08 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  48.35 
 
 
292 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  70.42 
 
 
801 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  64.56 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  44.11 
 
 
298 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  71.33 
 
 
493 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  45.96 
 
 
295 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  45.53 
 
 
285 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  75.59 
 
 
547 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  73.81 
 
 
498 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  75.4 
 
 
461 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  44.4 
 
 
304 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  74.6 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  41.44 
 
 
301 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  41.83 
 
 
319 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  74.02 
 
 
489 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  42.59 
 
 
311 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  72.66 
 
 
451 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  40.93 
 
 
319 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  67.72 
 
 
380 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  60.48 
 
 
535 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  60.66 
 
 
492 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  63.25 
 
 
374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  56.8 
 
 
469 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  59.13 
 
 
801 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  58.26 
 
 
558 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  58.33 
 
 
603 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  58.2 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  48.36 
 
 
548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  49.61 
 
 
589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  45.08 
 
 
497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  46.22 
 
 
368 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.42 
 
 
567 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  45.86 
 
 
801 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  42.28 
 
 
479 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.61 
 
 
933 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  42.74 
 
 
803 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  43.9 
 
 
634 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  43.51 
 
 
373 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  45.9 
 
 
568 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  39.85 
 
 
492 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 
391 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  41.48 
 
 
494 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.84 
 
 
709 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.21 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  43.7 
 
 
574 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.88 
 
 
531 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
1072 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  38.14 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  32.68 
 
 
890 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  41.13 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  38.06 
 
 
642 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  38.26 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.75 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  41.38 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.09 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.24 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  43.75 
 
 
824 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.06 
 
 
1207 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  38.76 
 
 
1016 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.75 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.23 
 
 
732 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.25 
 
 
627 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.2 
 
 
756 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  34.75 
 
 
1128 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.89 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  36.75 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.5 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.06 
 
 
580 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  39.66 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.5 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  34.75 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.06 
 
 
597 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.76 
 
 
695 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  36.67 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.22 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.68 
 
 
436 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35.59 
 
 
1577 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  35.71 
 
 
943 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.27 
 
 
482 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.59 
 
 
794 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  31.06 
 
 
333 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.59 
 
 
884 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.43 
 
 
474 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  36.59 
 
 
957 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  45.33 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32.14 
 
 
358 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  31.82 
 
 
653 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.07 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  30.14 
 
 
503 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.43 
 
 
982 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.66 
 
 
1139 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  40.24 
 
 
672 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  32 
 
 
806 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  32 
 
 
806 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  32 
 
 
806 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>