More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2626 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 521 aa  1021    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 491 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  60.86 
 
 		 486 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 		 477 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 495 aa  97.4  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 464 aa  93.6  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  25.24 
 
 		 481 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 506 aa  90.5  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 475 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.49 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.63 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  24.85 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.82 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.79 
 
 		 456 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  27.18 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.04 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  26.17 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.44 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25.14 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.83 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  23.66 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.25 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.09 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27.67 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  24.29 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  24.29 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  24.29 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  24.29 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  24.29 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  29.82 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  24.29 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.62 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  24.05 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  24.05 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>