226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2471 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
108 aa  207  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  63.24 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  61.54 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.03 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  60.29 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  62.5 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
74 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  59.02 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  53.62 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  63.93 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  47.78 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  59.68 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  60.66 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  41.67 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  54.1 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  61.54 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  40.74 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  53.12 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
70 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50.75 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  51.61 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  52.24 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  43.55 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50.82 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  51.67 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  50.72 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  62.5 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  60.71 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  34.04 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  57.14 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  56 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  45.31 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45.76 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  37.7 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  42.37 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40.62 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  51.02 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  41.27 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  40.98 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  39.68 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  40.68 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
228 aa  47.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  41.67 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.88 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.88 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
65 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
739 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  39.06 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
839 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
762 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  34.85 
 
 
803 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>