218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2449 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
402 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  69.49 
 
 
395 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  69.31 
 
 
397 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  66.34 
 
 
395 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  65.52 
 
 
398 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  65.9 
 
 
395 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  66.67 
 
 
399 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  65.51 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  63.68 
 
 
384 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  59.07 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  59.7 
 
 
409 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  58.67 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  57.18 
 
 
410 aa  448  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  56.42 
 
 
407 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  51.52 
 
 
393 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  53.37 
 
 
410 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  53.35 
 
 
412 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  52.39 
 
 
430 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  51.26 
 
 
393 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  52.03 
 
 
407 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  48.9 
 
 
404 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  51.75 
 
 
406 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  51.96 
 
 
398 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  51.11 
 
 
406 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  52.63 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  50.88 
 
 
393 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  51 
 
 
411 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  50.75 
 
 
409 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  50.75 
 
 
407 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  50.76 
 
 
407 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  51.02 
 
 
407 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  51.02 
 
 
407 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  50.25 
 
 
428 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  49.87 
 
 
411 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  49.62 
 
 
411 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  50.25 
 
 
407 aa  362  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  50 
 
 
401 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  50 
 
 
409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  49.87 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  47.15 
 
 
408 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  48.99 
 
 
398 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  47.39 
 
 
408 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  47.03 
 
 
408 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  48.77 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  48.23 
 
 
409 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  50.13 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  47.15 
 
 
408 aa  352  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  47.15 
 
 
408 aa  352  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  48.12 
 
 
405 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  47.15 
 
 
408 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  48.37 
 
 
405 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  47.15 
 
 
408 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  49.24 
 
 
404 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  47.87 
 
 
405 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  47.15 
 
 
408 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  46.4 
 
 
408 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  48.88 
 
 
398 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  48.48 
 
 
384 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  50.91 
 
 
715 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  50.91 
 
 
715 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  46.32 
 
 
388 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  45.36 
 
 
390 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  46.13 
 
 
389 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  44.22 
 
 
385 aa  289  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  44.65 
 
 
388 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  39.36 
 
 
396 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  39.69 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  35.97 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  34.7 
 
 
462 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  36.76 
 
 
474 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  35.06 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  34.42 
 
 
470 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  32.27 
 
 
447 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  31.23 
 
 
396 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  32.3 
 
 
400 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  34.01 
 
 
473 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.68 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  31.08 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  34.69 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  32.58 
 
 
480 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  32.13 
 
 
480 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  31.96 
 
 
475 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  32.36 
 
 
480 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  31.1 
 
 
472 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  31.98 
 
 
486 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  31.88 
 
 
500 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 
391 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  33.67 
 
 
478 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  31.9 
 
 
462 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  31.69 
 
 
477 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  32.19 
 
 
477 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  35.01 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  32.01 
 
 
474 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  33.18 
 
 
478 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  31.7 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  32.01 
 
 
474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.5 
 
 
508 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  31.07 
 
 
476 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>