More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2340 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  68.09 
 
 		 719 aa  986    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  67.53 
 
 		 710 aa  938    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  59.57 
 
 		 674 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  60.98 
 
 		 713 aa  859    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  62.64 
 
 		 717 aa  880    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  65.88 
 
 		 708 aa  966    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  58.06 
 
 		 722 aa  784    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  53.08 
 
 		 770 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  60.98 
 
 		 713 aa  859    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  62.09 
 
 		 717 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  58.17 
 
 		 696 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  62.55 
 
 		 714 aa  895    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  58.96 
 
 		 722 aa  770    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  59.66 
 
 		 718 aa  858    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  55.71 
 
 		 729 aa  801    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  58.37 
 
 		 726 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  68.02 
 
 		 719 aa  985    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  57.85 
 
 		 701 aa  808    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  60.98 
 
 		 713 aa  859    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  100 
 
 		 729 aa  1461    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.83 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.94 
 
 		 692 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.98 
 
 		 695 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  38.97 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  39.66 
 
 		 670 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.46 
 
 		 680 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  38.77 
 
 		 679 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.22 
 
 		 673 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.62 
 
 		 694 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.8 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  35.86 
 
 		 695 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.15 
 
 		 667 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  36.83 
 
 		 697 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.48 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.3 
 
 		 683 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  37.57 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  36.35 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  37.5 
 
 		 694 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  36.49 
 
 		 701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  36.18 
 
 		 696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.77 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.71 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  36.32 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  36.32 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  36.86 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  36.88 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.27 
 
 		 694 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  36.32 
 
 		 689 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  35.61 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.32 
 
 		 692 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  39.26 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  37.87 
 
 		 686 aa  442  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  36.18 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.59 
 
 		 683 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  38.01 
 
 		 686 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.98 
 
 		 682 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.15 
 
 		 701 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  36.48 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  36.48 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  39.15 
 
 		 688 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.14 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  36 
 
 		 694 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  36.92 
 
 		 691 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.43 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  36.96 
 
 		 681 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  36.47 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  36.31 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  36.08 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  35.73 
 
 		 692 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.02 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  35.94 
 
 		 692 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  36.08 
 
 		 692 aa  422  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  35.16 
 
 		 690 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.14 
 
 		 688 aa  422  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.75 
 
 		 692 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  36.08 
 
 		 692 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.18 
 
 		 692 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  35.86 
 
 		 686 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  37.91 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.42 
 
 		 683 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  35.65 
 
 		 692 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  38.59 
 
 		 697 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  37.69 
 
 		 691 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  36.74 
 
 		 707 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.71 
 
 		 692 aa  415  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  34.85 
 
 		 689 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  37.32 
 
 		 687 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  36.69 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  33.95 
 
 		 697 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  35.62 
 
 		 685 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  35.24 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.04 
 
 		 683 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  36.19 
 
 		 687 aa  415  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  35.24 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  36.95 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  34.13 
 
 		 697 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>