132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2249 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 386 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  51.21 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  46.96 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  48.01 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  43.14 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  45.94 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  45.36 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  43 
 
 		 328 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  45.03 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  44.04 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  47.06 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.65 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  36.81 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.36 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.28 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.58 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  38.1 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  40.26 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.2 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  41.99 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  38.41 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  41.3 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  41.11 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 		 320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  41.11 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  40.16 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.77 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  34.85 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  39.1 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  39.06 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  38.72 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  33.23 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.23 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.86 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.08 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.9 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  31.9 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  34.96 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.7 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  29.01 
 
 		 307 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.64 
 
 		 622 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  31.37 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.06 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.06 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  34.42 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  29.46 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  29.66 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  25.08 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.08 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.08 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  24.72 
 
 		 308 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  25.08 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  30.87 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  24.72 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  29.77 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  32.98 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  27.91 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  28.69 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.25 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  29.25 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  24.75 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  29.87 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  31.65 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  25.08 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  24.75 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  24.01 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  24.5 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  29.3 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  29.89 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  31.73 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  34.78 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  30.16 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>