28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2147 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  64.53 
 
 
210 aa  264  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  68.23 
 
 
231 aa  262  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  67.89 
 
 
190 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  61.27 
 
 
210 aa  255  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  63.02 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  62.69 
 
 
223 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  62.69 
 
 
223 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  62.69 
 
 
223 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  67.32 
 
 
205 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  62 
 
 
222 aa  245  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  60.49 
 
 
210 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  61.42 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  61.93 
 
 
227 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  57.92 
 
 
233 aa  236  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  63.98 
 
 
235 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  53.65 
 
 
200 aa  205  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  48.17 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  45.18 
 
 
209 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  43.28 
 
 
267 aa  141  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0328  hypothetical protein  29.29 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  26.12 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  29.2 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  29.2 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  29.2 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  26.52 
 
 
378 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  27.86 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>